Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00612Q8N6U2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms