Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSGALNACT2Q8N6G5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms