Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG9AQ7Z3C6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms