Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SV2AQ7L0J3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms