Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCA2Q69YH5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCA2Q69YH5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms