Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LHX8Q68G74 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LHX8Q68G74 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms