Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1DP3Q658K8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1DP3Q658K8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 351.2 ms