Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC158Q5M9N0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms