Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCID2Q5JVF3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCID2Q5JVF3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms