Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM259Q4ZIN3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms