Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrch2Q3UMG5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms