Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M3Q31093 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms