Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN1Q16799 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN1Q16799 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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