Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF239Q16600 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF239Q16600 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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