Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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SGCAQ16586 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SGCAQ16586 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SGCAQ16586 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SGCAQ16586 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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SGCAQ16586 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCAQ16586 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SGCAQ16586 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SGCAQ16586 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SGCAQ16586 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SGCAQ16586 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCAQ16586 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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