Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
E2F4Q16254 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F4Q16254 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F4Q16254 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms