Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH1Q15438 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH1Q15438 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH1Q15438 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH1Q15438 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYTH1Q15438 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH1Q15438 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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