Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD6Q15008 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD6Q15008 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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