Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSLNQ13421 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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