Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H3Q13133 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H3Q13133 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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