Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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