Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECH1Q13011 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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