Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata4Q08369 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata4Q08369 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms