Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX4Q06945 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX4Q06945 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms