Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3AP98173 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM3AP98173 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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