Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPD1P62314 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPD1P62314 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms