Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSCP56915 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSCP56915 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSCP56915 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSCP56915 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSCP56915 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSCP56915 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GSCP56915 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSCP56915 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSCP56915 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSCP56915 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSCP56915 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSCP56915 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSCP56915 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSCP56915 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSCP56915 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSCP56915 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSCP56915 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSCP56915 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSCP56915 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSCP56915 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSCP56915 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSCP56915 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GSCP56915 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSCP56915 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSCP56915 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSCP56915 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSCP56915 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GSCP56915 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GSCP56915 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSCP56915 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSCP56915 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSCP56915 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSCP56915 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSCP56915 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSCP56915 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSCP56915 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSCP56915 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GSCP56915 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSCP56915 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSCP56915 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSCP56915 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSCP56915 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms