Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NAP1L1P55209 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NAP1L1P55209 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NAP1L1P55209 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms