Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2A2P52657 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2A2P52657 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2A2P52657 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms