Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 MDJ2YNL328C 441 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 COS1YNL336W 1146 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 HNT3YOR258W 654 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YPR078CYPR078C 1119 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 STE24YJR117W 1362 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YDL199CYDL199C 2064 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 IOC3YFR013W 2364 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 SLH1YGR271W 5904 nt2.94□□□□□ -1.94
DDI1P40087 CEX1YOR112W 2286 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 APA2YDR530C 978 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YGL214WYGL214W 486 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 ADH4YGL256W 1149 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YVH1YIR026C 1095 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 EMC2YJR088C 879 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 OST6YML019W 999 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YBL096CYBL096C 309 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 TUM1YOR251C 915 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YBR053CYBR053C 1077 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 DBP7YKR024C 2229 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YTA7YGR270W 4140 nt2.93□□□□□ -1.94
DDI1P40087 JEN1YKL217W 1851 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 ENA5YDR038C 3276 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 VBA4YDR119W 2307 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YDR290WYDR290W 330 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 IZH1YDR492W 951 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 PMI40YER003C 1290 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 DDI2YFL061W 678 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 MTC3YGL226W 372 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 YHL045WYHL045W 348 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 AHP1YLR109W 531 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 RFC3YNL290W 1023 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 DDI3YNL335W 678 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 MUM2YBR057C 1101 nt2.92□□□□□ -1.94
DDI1P40087 LRG1YDL240W 3054 nt2.91□□□□□ -1.94
DDI1P40087 MON1YGL124C 1935 nt2.91□□□□□ -1.94
DDI1P40087 NDC80YIL144W 2076 nt2.91□□□□□ -1.94
DDI1P40087 STP2YHR006W 1626 nt2.91□□□□□ -1.94
DDI1P40087 QCR10YHR001W-A 234 nt2.91□□□□□ -1.94
DDI1P40087 PHO88YBR106W 567 nt2.91□□□□□ -1.94
DDI1P40087 JJJ1YNL227C 1773 nt2.91□□□□□ -1.94
DDI1P40087 HRD1YOL013C 1656 nt2.91□□□□□ -1.94
DDI1P40087 TSC11YER093C 4293 nt2.9□□□□□ -1.94
DDI1P40087 BNA4YBL098W 1383 nt2.9□□□□□ -1.94
DDI1P40087 UBP14YBR058C 2346 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 HUL5YGL141W 2733 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 BSC1YDL037C 987 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 SMT3YDR510W 306 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 GRX2YDR513W 432 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 CFD1YIL003W 882 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 ATP12YJL180C 978 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 AIM25YJR100C 984 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YOL024WYOL024W 519 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YPL035CYPL035C 348 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 GPI2YPL076W 843 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 POS5YPL188W 1245 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 PIN3YPR154W 648 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 MDM1YML104C 3384 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 FLO1YAR050W 4614 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 LCB4YOR171C 1875 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 PIN4YBL051C 2007 nt2.9□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YLR278CYLR278C 4026 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 RPS14AYCR031C 414 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 HIM1YDR317W 1245 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 GPP2YER062C 753 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 CBP2YHL038C 1893 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 EPT1YHR123W 1176 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 SDP1YIL113W 630 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 DID4YKL002W 699 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 SFH1YLR321C 1281 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YMR141CYMR141C 309 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YPR053CYPR053C 456 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 GRX1YCL035C 333 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 TDA1YMR291W 1761 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YPS6YIR039C 1614 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 COM2YER130C 1332 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 INP52YNL106C 3552 nt2.89□□□□□ -1.95
DDI1P40087 SPO14YKR031C 5052 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 NUF2YOL069W 1356 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 TIF4631YGR162W 2859 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 EXO5YBR163W 1758 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YDL241WYDL241W 372 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 NKP1YDR383C 717 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 POP6YGR030C 477 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 DOG1YHR044C 741 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 SNX4YJL036W 1272 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 SDH3YKL141W 597 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 RPC37YKR025W 849 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YLR311CYLR311C 348 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 HHF2YNL030W 312 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 CIN1YOR349W 3045 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 CET1YPL228W 1650 nt2.88□□□□□ -1.95
DDI1P40087 MDV1YJL112W 2145 nt2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.3 ms