Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC4P35249 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFC4P35249 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFC4P35249 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RFC4P35249 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFC4P35249 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFC4P35249 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC4P35249 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC4P35249 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC4P35249 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC4P35249 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC4P35249 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC4P35249 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC4P35249 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC4P35249 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC4P35249 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFC4P35249 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC4P35249 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC4P35249 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC4P35249 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC4P35249 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC4P35249 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC4P35249 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFC4P35249 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC4P35249 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC4P35249 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC4P35249 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC4P35249 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC4P35249 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC4P35249 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC4P35249 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC4P35249 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RFC4P35249 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RFC4P35249 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC4P35249 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC4P35249 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC4P35249 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC4P35249 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC4P35249 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC4P35249 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC4P35249 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC4P35249 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RFC4P35249 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFC4P35249 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFC4P35249 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFC4P35249 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFC4P35249 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFC4P35249 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFC4P35249 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFC4P35249 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms