Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER1P34995 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER1P34995 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER1P34995 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER1P34995 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER1P34995 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER1P34995 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER1P34995 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER1P34995 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTGER1P34995 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGER1P34995 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTGER1P34995 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER1P34995 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms