Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBP1P32455 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP1P32455 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP1P32455 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP1P32455 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP1P32455 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP1P32455 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP1P32455 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP1P32455 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP1P32455 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP1P32455 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GBP1P32455 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GBP1P32455 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GBP1P32455 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GBP1P32455 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GBP1P32455 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GBP1P32455 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP1P32455 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms