Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR5P32302 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR5P32302 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms