Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTFP26441 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTFP26441 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTFP26441 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTFP26441 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTFP26441 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTFP26441 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTFP26441 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTFP26441 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTFP26441 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTFP26441 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNTFP26441 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms