Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRDP23468 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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