Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms