Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A1P19634 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A1P19634 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms