Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD58P19256 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD58P19256 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD58P19256 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD58P19256 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CD58P19256 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD58P19256 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD58P19256 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD58P19256 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD58P19256 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD58P19256 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD58P19256 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD58P19256 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD58P19256 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD58P19256 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD58P19256 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD58P19256 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD58P19256 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD58P19256 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD58P19256 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD58P19256 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD58P19256 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD58P19256 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD58P19256 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD58P19256 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD58P19256 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD58P19256 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD58P19256 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD58P19256 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD58P19256 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD58P19256 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD58P19256 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD58P19256 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD58P19256 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms