Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF4P18085 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF4P18085 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF4P18085 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF4P18085 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF4P18085 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF4P18085 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARF4P18085 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARF4P18085 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARF4P18085 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARF4P18085 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARF4P18085 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARF4P18085 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARF4P18085 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARF4P18085 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARF4P18085 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARF4P18085 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms