Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GM2AP17900 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GM2AP17900 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GM2AP17900 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GM2AP17900 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GM2AP17900 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GM2AP17900 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GM2AP17900 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GM2AP17900 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GM2AP17900 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GM2AP17900 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GM2AP17900 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GM2AP17900 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GM2AP17900 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GM2AP17900 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GM2AP17900 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GM2AP17900 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GM2AP17900 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GM2AP17900 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GM2AP17900 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GM2AP17900 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GM2AP17900 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms