Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF4P15884 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF4P15884 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF4P15884 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF4P15884 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF4P15884 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF4P15884 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF4P15884 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF4P15884 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF4P15884 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF4P15884 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF4P15884 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF4P15884 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF4P15884 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF4P15884 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF4P15884 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF4P15884 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF4P15884 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF4P15884 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF4P15884 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF4P15884 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF4P15884 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF4P15884 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF4P15884 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF4P15884 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF4P15884 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF4P15884 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF4P15884 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF4P15884 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF4P15884 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF4P15884 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF4P15884 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF4P15884 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF4P15884 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCF4P15884 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCF4P15884 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCF4P15884 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms