Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT3P12035 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT3P12035 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT3P12035 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT3P12035 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT3P12035 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT3P12035 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT3P12035 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT3P12035 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT3P12035 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT3P12035 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT3P12035 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT3P12035 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT3P12035 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT3P12035 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT3P12035 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT3P12035 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT3P12035 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT3P12035 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT3P12035 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT3P12035 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT3P12035 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT3P12035 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT3P12035 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT3P12035 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT3P12035 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT3P12035 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT3P12035 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT3P12035 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT3P12035 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT3P12035 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT3P12035 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT3P12035 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT3P12035 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT3P12035 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms