Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxb5P09079 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hoxb5P09079 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hoxb5P09079 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb5P09079 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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