Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSP90AB1P08238 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSP90AB1P08238 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms