Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOBTB3O94955 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms