Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH1A2O94788 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH1A2O94788 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms