Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEBLO76041 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEBLO76041 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEBLO76041 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEBLO76041 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEBLO76041 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEBLO76041 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEBLO76041 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEBLO76041 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEBLO76041 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEBLO76041 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEBLO76041 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEBLO76041 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEBLO76041 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEBLO76041 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEBLO76041 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEBLO76041 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEBLO76041 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEBLO76041 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEBLO76041 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEBLO76041 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEBLO76041 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEBLO76041 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEBLO76041 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEBLO76041 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEBLO76041 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEBLO76041 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEBLO76041 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEBLO76041 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEBLO76041 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEBLO76041 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEBLO76041 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEBLO76041 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEBLO76041 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms