Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REV3LO60673 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REV3LO60673 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REV3LO60673 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REV3LO60673 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REV3LO60673 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REV3LO60673 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REV3LO60673 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REV3LO60673 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REV3LO60673 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REV3LO60673 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REV3LO60673 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REV3LO60673 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REV3LO60673 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REV3LO60673 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REV3LO60673 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REV3LO60673 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REV3LO60673 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REV3LO60673 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REV3LO60673 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REV3LO60673 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
REV3LO60673 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REV3LO60673 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REV3LO60673 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REV3LO60673 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REV3LO60673 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REV3LO60673 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REV3LO60673 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REV3LO60673 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REV3LO60673 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REV3LO60673 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REV3LO60673 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REV3LO60673 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REV3LO60673 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REV3LO60673 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REV3LO60673 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REV3LO60673 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REV3LO60673 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REV3LO60673 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REV3LO60673 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REV3LO60673 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REV3LO60673 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV3LO60673 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV3LO60673 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV3LO60673 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV3LO60673 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV3LO60673 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV3LO60673 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV3LO60673 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
REV3LO60673 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV3LO60673 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV3LO60673 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REV3LO60673 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
REV3LO60673 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms