Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX16O60231 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX16O60231 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX16O60231 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX16O60231 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX16O60231 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX16O60231 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX16O60231 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX16O60231 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX16O60231 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX16O60231 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX16O60231 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX16O60231 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX16O60231 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX16O60231 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX16O60231 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX16O60231 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX16O60231 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX16O60231 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX16O60231 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX16O60231 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX16O60231 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX16O60231 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DHX16O60231 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DHX16O60231 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DHX16O60231 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DHX16O60231 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DHX16O60231 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHX16O60231 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHX16O60231 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHX16O60231 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHX16O60231 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHX16O60231 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHX16O60231 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHX16O60231 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX16O60231 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX16O60231 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX16O60231 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX16O60231 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX16O60231 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX16O60231 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX16O60231 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX16O60231 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX16O60231 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX16O60231 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX16O60231 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX16O60231 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms